Football League 1. divisjon 1999–2000 var den 101. sesongen i The Football League og den åttende sesongen der Football Leagues 1. divisjon var det nest øverste nivået i engelsk fotball. Charlton Athletic vant og rykket direkte opp til FA Premier League sammen med Manchester City som kom på 2.-plass. Ipswich Town rykket opp til FA Premier League etter at de vant play-off.
Etter opprettelsen av FA Premier League ble det nest høyeste nivået i engelsk fotball Football League 1. divisjon fra og med 1992–93-sesongen. Fra og med sesongen 2004–05 ble navnet på divisjonen endret til Football League Championship, ofte forkortet til The Championship.
Vinner av 1. divisjon, opprykk til FA Premier League
2.-plass i 1. divisjon, opprykk til FA Premier League
Vinner av play-off, opprykk til FA Premier League
Deltaker i play-off
Nedrykk til 2. divisjon
Opprykk til FA Premier League – Play-off
Play-off ble spilt der klubbene som kom på tredje, fjerde, femte og sjetteplass i 1. divisjon spilte om en plass i FA Premier League. De to beste klubbene i 1. divisjon rykket automatisk opp til FA Premier League.
De to beste klubbene i 2. divisjon rykket automatisk opp til 1. divisjon og de tre dårligste klubbene i 1. divisjon rykket automatisk ned til 2. divisjon. Play-off ble spilt der klubbene som kom på tredje, fjerde, femte og sjetteplass i 2. divisjon spilte om en plass i 1. divisjon.