Han var fra 1951 ansatt som glasskunstner ved Norsk Glassverk på Magnor, hvor han oppnådde høy faglig og kunstnerisk anerkjennelse. Han fikk Statens brukskunstnerstipend for 1954/55. Fra 1955 ble han ansatt som kunstnerisk leder ved Stavangerflint hvor han var til 1958. Der utviklet han nye former for bedriftens produkter, blant annet servisene «Utstein» og «Ledaal». Disse ble produsert i mange år både med ensfargede dekorer som gjorde at servisene kunne settes sammen i flere ulike kombinasjoner, men også med dekorer av andre kunstnere ved bedriften.
Brukskunstnerne Inger Waage, Anne Lofthus og Kari Nyquist har laget mange av sine mest kjente dekorer på former designet av Sandnes. Et teservise med form av Eystein Sandnes og dekor av Kari Nyquist ble midt på 1950-tallet innkjøpt av Victoria and Albert Museum i London. Det var Sandnes som introduserte prinsippene bak begrepet Scandinavian design ved Stavangerflint.
Han har mottatt Norsk Designråds priser for God design i 1965, 1969 og 1971. I 1960 fikk han sølvmedalje ved den 12. Triennalen i Milano for et mokkaservise i porselen. Sandnes har deltatt på mange utstillinger i Norge og i utlandet og er representert i mange samlinger, blant annet Kunstindustrimuseet i Oslo og Victoria and Albert Museum i London.