Han arbeidet på Doctor Who mens William Hartnell spilte Doktoren og han introduserte komiske elementer i serien. Han skrev historiene The Reign of Terror, The Romans og The Time Meddler. Han skrev også noen episoder av historien The Daleks' Master Plan og jobbet som manusredaktør på serien fra og med The Rescue og til og med The Chase i 1965. Han valgte å ikke fortsette i denne jobben etter at arbeidskontrakten hans på seks måneder utløpte. Skaperen av dalekene, Terry Nation, hadde akkurat tatt over jobben som manuskriptredaktør på den nye serien The Baron og ba om Spooners hjelp til å skrive for den. Spooner ble fristet av sjansen til å jobbe på en serie som ville bli vist på det innbringende amerikanske markedet og han takket derfor ja til jobben.
