Referanseløs: Denne artikkelen inneholder en liste over kilder, litteratur eller eksterne lenker, men enkeltopplysninger lar seg ikke verifisere fordi det mangler konkrete kildehenvisninger i form av fotnotebaserte referanser. Du kan hjelpe til med å sjekke opplysningene mot kildemateriale og legge inn referanser. Opplysninger uten kildehenvisning i form av referanser kan bli fjernet.
Daniel Fenton, en 14 år gammel gutt som bor i den lille byen Amity Park, bor sammen med hans spøkelsesjaktende eksentriske foreldre, Jack og Madeline og hans overbeskyttende, men omsorgsfulle 17 år gamle søster, Jasmine. Etter press fra sine to beste venner, Samantha Manson og Tucker Foley, bestemmer Danny seg for å utforske en spøkelsesportal opprettet av foreldrene hans i deres forsøk på å bygge en bro mellom sin menneskelige verden og spøkelsessonen (det parallelle universet hvor spøkelser holder til)
Daniel aktiverte portalen og infiserte hans eget DNA med ektoplasma, noe som forvandlet ham til et halvt spøkelse. Daniel kaller seg for Danny Phantom i spøkelsesform, utvikler evnen til å fly, og bli usynlig, samt kontrollere mennesker. Over tid utvikler Daniel mye sterkere evner, for eksempel hans Ghost Ray (en konsentrert energi-sprengning som han kan skyte fra hånden) og til og med kryokinesis.
Daniel er først redd for hans nye evner, og har liten kontroll over dem. Men han lærer snart å bruke dem til å beskytte hjembyen hans mot ondsinnede ånder. Danny begynner deretter som superhelt. Samantha, Tucker og Jasmine er Daniels viktigste allierte når han bekjemper spøkelser, samtidig som han forsøker å holde sin halvdel som spøkelse hemmelig. I den virkelige verden er håret hans svart, men dette blir hvitt etter at han forvandler seg til et spøkelse. De blå øynene hans blir grønne, etter at han forvandler seg til spøkelse.