Daniel Flores ble født i Palacios i Texas til Fernando og Lydia Flores,[1] som begge var født til familier lenge etablert rundt Zapata i Zapata County helt sør i Texas med røtter på begge sider av grensen mellom USA og Mexico.[2]
Han innehadde en rekke høye stillinger i bispedømmet, og i 1997 ble Flores sendt til Roma av biskop Roberto Nieves for utterlugere studier. I 2000 mottok Flores doktorgraden i teologi fra Angelicum.[trenger referanse]
Tilbake i Texas var Flores kansler i bispedømmet Corpus Christi. I august 2001, ble han assignert til erkebispedømmet Galveston-Houston der han var professor i teologi ved University of St. Thomas i Houston og formation director[klargjør] ved St. Mary's Seminary i Houston, der han også var viserektor (2002–2006).[3] I september 2005 ble Flores rektor for Corpus Christi Cathedral Parish, og tiltrådte der fullt ut i juni 2006.[1]
Han ble utnevnt til biskop av Brownsville i Texas den 9. desember 2009, og ble innsatt i embedet 2. februar året etter.[2] Han etterfulgte biskop Raymundo Peña.[4] Brownsville ligger langs Rio Grande, som i Texas er grenseelven mellom USA og Mexico.[trenger referanse]
«“I feel that as a (bishops’) conference, we must express ourselves more strongly when it comes to the dignity of immigrants, to say that they are not criminals, that they are vulnerable families and we need to invite all the governments involved, not just the U.S., to defend the migrant as a human being, to not cast the person aside as someone who doesn’t matter and is a problem.»[5]
Den 16. november 2020 ble biskop Flores valgt til å lede Committee on Doctrine i USCCB.[6]