Aubert debuterte i 1992 med romanen Les quatre fils du Docteur March. Hun omtales ofte som en av Frankrikes fremste og mest nyskapende kvinnelige krimforfattere. Om sitt forfatterskap har hun uttalt at hun lenge kjente seg ensom blant franske krimforfattere, siden hun ikke skrev sosialrealistiske krimromaner, men «thrillere og noen ganger makabre komedier». Hun siteres også på at «Jeg tar ikke opp seriøse, viktige temaer som urbanisme og proletariatet. Jeg skriver for underholdning.»
Hennes roman La Mort des bois vant Grand Prix de littérature policière for beste franskspråklige kriminalroman utgitt i 1996.
Utover sitt kriminallitterære forfatterskap skriver Aubert barnebøker, og arbeider med film og TV. Hun skriver dreiebeøker og produserer blant annet TV-serien Série Noir for det franske TV-selskapet TF1.