Foran 2020-sesongen kom det i stand en samarbeidsavtale mellom Aalesunds Fotballklubb og FK Fortuna Ålesund. En avtale som blant annet innebar at klubben skiftet navn til AaFK Fortuna og tok i bruk AaFK sine drakter.[1]
Klubben ble stiftet som Fotballklubben Fortuna Ålesund den 25. august1991 av en utbrytergruppe fra Sportsklubben Guard, etter uenigheter om satsing på kvinnefotball.[2]
Sammenslått med Spjelkavik (1995)
I 1995 tok de over plassen til Spjelkavik Idrettslag, som i sin ene sesong på topp i 1. divisjon 1992 hadde endt sist, og slet med videre rekruttering. Etter ett år som Spjelkavik IL/Fortuna i 1. divisjon (andre nivå), fikk de navnet Fortuna Ålesund i 1996.
Andre nivå (1996–2008)
Den tidligere landslagskjempen Tone Haugen ble senhøstes 1999 annonsert som spillende trener og virket i fire sesonger.[3]
I 2000 vant laget 1. divisjon avdeling 5, og spilte kvalifisering mot Liungen Idrettsforening og Fløya IF. Fortuna tapte på målforskjell, og måtte fortsette i 1. divisjon. Imidlertid betydde kvalifiseringen at Fortuna hadde kvalifisert seg til den nasjonale 1. divisjon.
Sesongene 2001–06 plasserte de seg 6., 6., 6., 5., 5. og 6. Haugen takket av etter 2003,[4] avløst som trener av Magne Kvalø, som fikk tre sesonger 2004–06, før han gikk til Valder.[5]
Med Svein Slinning[6] som trener i 2007 var laget svært nære å kvalifisere seg. Seier mot Fotballaget Fart i siste runde hadde holdt, men i stedet ble det tap og 4. plass.
Det ble enda mer spennende i 2008, da Fortuna knivet med Medkila Idrettslag og Manglerud/Star om den siste opprykksplassen bak IL Sandviken. Det så ut til å gå til Medkilas fordel da Fortuna tapte det innbyrdes oppgjøret. I siste runde falt avgjørelsen. Fortuna vant 5–1 mot Gjøvik Fotballklubb, mens Medkila noe overraskende tapte borte mot Fotballklubben Voss.
Ett år i toppdivisjonen (2009)
Andrelaget til Fortuna samarbeidet i 2008 med Sportsklubben Guard, og laget vant 3. divisjon avdeling Sunnmøre overlegent. I januar 2009 var det snakk om å slå sammen Guard og Fortuna igjen, men Fortuna stemte nei på det ekstraordinære årsmøtet.[7] I stedet valgte de samarbeid med Aalesunds Fotballklubb, og fikk dermed bruke Color Line Stadion i Toppserien 2009, der de ble sist og rykket ned med bare tre poeng etter 22 kamper. Slinning ga seg som trener etter 2009-sesongen.[8]
Andre nivå (2010–2016)
Trener i 2010 var Karl Oskar Fjørtoft, [9] det ga fjerde plass i 1. divisjon og cupens tredje runde. I 2011 var Ronny Ødegård hovedtrener.[10] Laget endte på 7. plass og kom til tredje runde i cupen.[11]
I perioden 2012–14 var Magne Elde hovedtrener.[12] Den irske landslagsspiller Marie Curtin spilte en sesong i klubben. Dårlig økonomi ga permitteringsvarsel til både trener og daglig leder, men man berges av banken.[13]
Laget endte i 2012 på en 9. plass og tok seg til andre runde av cupen. Året efter ble det 7. plass og ut i tredje runde av cupen. I 2014 ble det fjerdeplass og 3. runde i cupen.
Den islandske landslagstrener Helena Ólafsdóttir (født 1969) var trener fra 2015, ifølge styreleder Jan Ove Ervik, også delvis utleid til andre lokale fotballformål.[14] Anita Lisa Svansdottir var spiller og assistent og trente også Fortuna/Aksla i 3. divisjon.[15] Helena ga seg i april 2016.[16] Svein Arne Sunde overtok, men det ble nedrykk etter 11. plass og 17 poeng.[17]
Tredje nivå (2017–2019)
Med Magne Elde tilbake som trener vant Fortuna sin første sesong på tredje nivå (6. avdeling i 2. divisjon) men tapte for 1–6 for Nanset Idrettsforening i kvalifiseringen og rykket ikke opp. I cupen tapte de 0–7 for LSK Kvinner. Med Magne Elde som trener vant Fortuna Norgesmesterskapet i fotball for jenter 19 år med seier 2–1 over Arna-Bjørnar den 17. november 2017.[18] Magne Elde fortsatte i 2018 og 2019 og ledet klubben i 2. divisjon. [19]
AaFK Fortuna (2020–)
I forkant av 2020-sesongen kom det i stand en samarbeidsavtale mellom Aalesunds Fotballklubb og FK Fortuna. Avtalen, som i første omgang hadde en varighet på tre år, innebærer en videreutvikling av det som i mange år har vært FK Fortuna. Navnet ble endret til AaFK Fortuna, og laget skulle heretter spille i AaFK-drakter. Den nye satsingen ville ligge i Fortuna med adskilt organisasjon, økonomi og inntekter, men med nært samarbeid for å utvikle klubbene.[20]
Tidlig i 2021 overtok tidligere AaFK-spiller Frode Fagermo som trener.[21] I 2021-sesongen vant AaFK Fortuna sin avdeling i 2. divisjon, med ni av ni seiere og 41–2 i målforskjell. Et høydepunkt i sesongen var når de vant 4–1 over Toppserielaget Lyn i cupens 2. runde.[22] I opprykkskvalifiseringen slo de Frigg og Bossekop og rykket dermed opp til 1. divisjon.[23] Etter sesongen signerte Frode Fagermo en ny kontrakt som hovedtrener ut 2023-sesongen.[24]
