Zhijan maakte zijn debuut in het internationale (senioren)circuit op het Zweden Open 1996, een toernooi in het kader van de ITTF Pro Tour. Hij bereikte daarop de halve finale in het dubbelspel, een voorbode voor wat zijn succesvolste discipline zou blijken. Zhijan zou namelijk nooit een enkelspeltitel winnen op de Pro Tour, ondanks dat hij twee finales haalde. De Chinees schreef daarentegen van 1998 tot en met 2002 wel zeven dubbeltitels op de Pro Tour op zijn naam.
Niet alleen de Pro Tour, maar ook alle drie de wereldkampioenschappen waaraan Zhijan deelnam, leverden hem eremetaal op. Bijna vanzelfsprekend nam hij al zijn mondiale medailles in ontvangst met een partner aan zijn zijde. Op zijn eerste WK in Eindhoven 1999 was dat een bronzen, die hij samen met landgenote Yang Ying won in het gemengd dubbelspel. Samen keerden ze in Osaka 2003 terug om ditmaal de finale te bereiken en daaraan goud te winnen, ten koste van het Zuid-Koreaanse duo Oh Sang Eun/Kim Moo-kyo.
Zhijans derde WK in Parijs 2003 leverde hem geen tweede wereldtitel op, maar wel nog twee bronzen medailles. Hij stond in het gemengd dubbelspel ditmaal op het podium samen met Niu Jianfeng, terwijl hij ook in het dubbelspel voor mannen brons won samen met Ma Lin.
Loopbaan als coach
Qin maakt als coach deel uit van het nationale team van China, dat in zijn geheel geleid wordt door Liu Guoliang. Hij is de hoofdcoach van het mannenteam. Daarnaast is hij ook de persoonlijke coach van olympisch kampioen 2016 Ma Long.