Tussen 1995 en begin 2005 was hij hoogleraar aan het Leids Universitair Medisch Centrum met als specialisatie ophthalmo-oncologie en was afdelingshoofd oogheelkunde. Hij was daarnaast tussen 1995 en 2008 wetenschappelijk secretaris en secretaris van het Nederlands Oogheelkundig Gezelschap (NOG).[1]
Van 2004 tot 2014 was Keunen afdelingshoofd oogheelkunde, professor en opleider aan het Radboudumc in Nijmegen. Hij deed onderzoek naar netvliesaandoeningen (waaronder maculadegeneratie), oogtumoren en laserchirurgie. Onder zijn leiding werden nieuwe lasertechnieken als de microseconden-laser (2007) en de patroonlaser (2008) in Nijmegen als eerste in Nederland geïntroduceerd. Vanaf 2014 werkte hij als opleider. In 2019 ging Keunen met emeritaat. Hij begeleidde 17 promovendi en schreef 167 peer-reviewed wetenschappelijke publicaties en meer dan 200 vakpublicaties in de media, waaronder opiniestukken in NRC Handelsblad, Trouw en De Volkskrant.[1][3][4][5] Op 4 juni 2021 nam Keunen met een lezing in de Sint-Stevenskerk afscheid van de Radboud Universiteit. Bij deze gelegenheid werd hij gedecoreerd tot Officier in de Orde van Oranje-Nassau.[6]
Van 2014 tot 2020 was Keunen lid van de Gezondheidsraad en sinds 2003 voorzitter van de WHO-werkgroep VISION 2020 Netherlands om vermijdbare blindheid en slechtziendheid te verminderen. Hij zet zich in voor de gevaren van lasers en met name consumentenvuurwerk. Keunen pleit actief voor een vuurwerkverbod en het gebruik van vuurwerkbrillen en komt hiermee regelmatig in de media.[7] In 2014 was hij een van de twee initiatiefnemers van het landelijk Vuurwerkmanifest, dat in 2020 door 670.000 mensen en 1.300 landelijke organisaties is ondertekend.[8]
Politiek
Hij is sinds 1990 lid van de VVD en binnen die partij sinds 2000 lid van de partijcommissie Volksgezondheid (later: landelijk themanetwerk Gezondheid en Zorg).[9] Daarnaast was hij voorzitter van VVD Nijmegen vanaf 2014 en vervolgens van VVD Rijk van Nijmegen, die ontstond uit een fusie met 7 omliggende gemeenten in 2016. Hij bleef voorzitter tot januari 2019 en is nog steeds vicevoorzitter van het bestuur van VVD Rijk van Nijmegen.[10] Bij de Eerste Kamerverkiezingen 2019 stond hij op plaats veertien op de kandidatenlijst, wat niet voldoende was om gekozen te worden.[11] Op 26 oktober 2020 werd hij alsnog geïnstalleerd als lid van de Eerste Kamer in de vacature die ontstond na het aftreden van Roel Wever in verband met zijn benoeming tot burgemeester.[12] De nummer 13 op de lijst, Avine Fokkens-Kelder, had als lid van Gedeputeerde Staten van Friesland sinds 26 juni 2019 bedankt.[13] Keunen zou tot en met 12 juni 2023 Eerste Kamerlid blijven, nadat hij zich niet opnieuw verkiesbaar had gesteld.[14][15] Sinds 8 september 2023 is hij algemeen bestuurslid van de VVD Gelderland.
Commissies
Commissie voor Binnenlandse Zaken en de Hoge Colleges van Staat / Algemene Zaken en Huis van de Koning
(en) Oosterhuis JA, Journée-de Korver HG, Keunen JE (februari 1998). Transpupillary thermotherapy: results in 50 patients with choroidal melanoma. Archives of Ophthalmology116 (2): 157–162. DOI: 10.1001/archopht.116.2.157.
(en) Sommerburg O, Keunen JE, Bird AC, van Kuijk FJ (augustus 1998). Fruits and vegetables that are sources for lutein and zeaxanthin: the macular pigment in human eyes. British Journal of Ophthalmology82 (8): 907–910. DOI: 10.1136/bjo.82.8.907.
(en) Boon CJ, den Hollander AI, Hoyng CB, Cremers FP, Klevering BJ (maart 2008). The spectrum of retinal dystrophies caused by mutations in the peripherin/RDS gene. Progress in Retinal and Eye Research27 (2): 213–235. DOI: 10.1016/j.preteyeres.2008.01.002.
(en) Boon CJ, Klevering BJ, Leroy BP, Hoyng CB, Keunen JE, den Hollander AI (mei 2009). The spectrum of ocular phenotypes caused by mutations in the BEST1 gene. Progress in Retinal and Eye Research28 (3): 187–205. DOI: 10.1016/j.preteyeres.2009.04.002.