Johannes Commelin (23 april1629 - 19 januari1692) was een Nederlandsbotanicus, evenals zijn neef: Casparus Commelin. Hij was de zoon van Isaac Commelin een Leidse uitgever en Amsterdamse historieschrijver. Als lid van de Amsterdamse vroedschap heeft hij met burgemeesterJoan Huydecoper van Maarsseveen de nieuwe Hortus Botanicus opgericht toen de oude hortus medicus moest wijken voor de stadsuitbreiding. Zijn rijkdom verwierf hij door het verkopen van medicinale planten aan Nederlandse apothekers en ziekenhuizen. Hij verbouwde tropische, door de VOC geïmporteerde planten op zijn Haarlemse buiten Zuyderhout.