Prêtre geldt als specialist van muziek uit zijn vaderland, in het bijzonder van werken van Francis Poulenc.
Op 1 januari 2008 dirigeerde hij het Nieuwjaarsconcert van de Wiener Philharmoniker en was hij met 83 jaar de oudste dirigent die tot op dat moment het Nieuwjaarsconcert gedirigeerd heeft. Op 1 januari 2010 dirigeerde hij opnieuw het Nieuwjaarsconcert.