De Baïse ontspringt als Grande Baïse uit het kanaal van de Neste. Nadat zij is samengesmolten met de Baïsole en de Petite Baïse komt zij Baïse te heten.
De Petite Baïse[2] is een samensmelting van de Baïse dernière (achterste Baïse) en de Baïse devant (voorste Baïse), die beide uit het kanaal van de Neste ontspringen en maar enkele kilometers lang zijn. De Petite Baïse vloeit na 75,1 km bij L'Isle-de-Noé in het departement Gers in de rechteroever van de Grande Baïse.
De Baïsole[3] ontspringt uit het kanaal van de Neste en vloeit na 47,2 km bij Saint-Michel in het departement Gers in de rechteroever van de Grand Baïse.
Een andere belangrijke zijrivier is de Gélise.
Loop van de Baïse
De rivier stroomt door de volgende departementen en steden: