Hierna ging zijn carrière snel. In 1665 was er een soort wedloop in vlagofficieren tussen de verschillende admiraliteiten en Auke werd op 17 maart van dat jaar benoemd tot eerste luitenant-admiraal van Friesland. Lang heeft hij niet van deze functie kunnen genieten. In de Slag bij Lowestoft sneuvelde hij als bevelhebber van het vierde eskader op de Zevenwolden, nog geen dertig jaar oud. Hij werd opgevolgd door Tjerk Hiddes de Vries die een jaar later zou sneuvelen in dezelfde Tweede Engels-Nederlandse Oorlog. De twee worden daarom vaak in één adem genoemd als Friese zeehelden.
