In 1904 werd de club opgericht als FC Bellinzona. Na een fusie met AC Daro in 1926 werd de naam AC Bellinzona aangenomen. Het hoogtepunt van de clubgeschiedenis werd bereikt in 1948 toen het landskampioen werd. Daarnaast stond het drie keer in de finale van de Zwitserse voetbalbeker.
In het seizoen 2007/2008 werd promotie naar de Super League behaald na winst in de barrages tegen FC St. Gallen. Na drie seizoenen degradeerde het weer naar de Challenge League. Op de voorlaatste speelronde stond de club op de laatste plaats en alleen winst kon er nog voor zorgen dat AC Bellinzona degradatie ontliep. De club won van Grasshopper Club Zürich en concurrent FC St. Gallen verloor bij BSC Young Boys. De Italiaanstaligen eindigden daarom als voorlaatste en namen toen deel aan de barragewedstrijden tegen Servette FC. Over twee wedstrijden was de runner-up van de Challenge League het sterkste, waardoor degradatie naar de Challenge League een feit was.
Daarna ging bergafwaarts met AC Bellinzona. Voor het seizoen 2013/2014 kreeg het alleen een licentie voor de Promotion League toegewezen, hierdoor volgde een verplichte degradatie naar het derde niveau. Op 17 september 2013 werden alle sportactiviteiten stopgezet en werd het uiteindelijk failliet verklaard.
Een doorstart kon gemaakt worden in de 2. Liga, de zesde klasse. Er volgden direct twee promoties op rij. In de 1. Liga Classic duurde het twee seizoenen eer promotie werd bewerkstelligd, in het eerste jaar werd AC Bellinzona namelijk uitgeschakeld in de promotieplay-offs. In het tweede jaar werden de play-offs tegen Red Star Zürich gewonnen, waardoor het in 2019 in de Promotion League mocht aantreden. Dit is de derde voetbalklasse van het Alpenland en tevens de hoogste amateurklasse.
In 2022 werden de Italiaanstaligen weliswaar tweede na de reguliere competitie, maar de daaropvolgende eindronde werd wel winnend afgesloten, waardoor het eerste eindigde in de eindrangschikking. Door het kampioenschap promoveerde AC Bellinzona naar de Challenge League.
De navolgende Europese voetballers kwamen als speler van AC Bellinzona uit voor een vertegenwoordigend A-elftal. Tot op heden[7] is Kubilay Türkyilmaz degene met de meeste interlands achter zijn naam. Hij kwam als speler van AC Bellinzona in totaal 12 keer uit voor het Zwitserse nationale elftal.
↑AC Bellinzona verliest van FC Aarau over twee duels (5-2) in de play-offs promotie/degradatie en loopt zodoende promotie mis naar de hoogste divisie.
↑AC Bellinzona verslaat FC St. Gallen over twee duels (5-2) in de play-offs promotie/degradatie en promoveert zodoende naar de hoogste divisie.
↑AC Bellinzona verslaat FC Lugano over twee duels (2-1) in de play-offs promotie/degradatie en handhaaft zich zodoende op het hoogste niveau.
↑AC Bellinzona verliest van Servette FC Genève over twee duels (2-3) in de play-offs promotie/degradatie en degradeert zodoende naar de Challenge League.
↑AC Bellizona werd wegens financiële onregelmatigheden teruggezet naar de derde klasse, met als gevolg dat de nummer laatst (FC Locarno) niet degradeerde.
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
