Ma dilantik menjadi Datuk Bandar Taipei pada tahun 1998 dan dilantik semula pada tahun 2002. Beliau dilantik menjadi Pengerusi Kuomintang oleh ahli-ahli parti pada 16 Julai 2005. Beliau mengumumkan perletakan jawatan pada 13 Februari 2007 setelah didakwa oleh Jabatan Pendakwa Tinggi Taiwan atas tuduhan salah guna dana ketika menyandang jawatan datuk bandar Taipei - beliau didapati tidak bersalah.[1] Ma akhirnya memenangi jawatan presiden di pilihan raya presiden 2008 dengan 58.45% undi popular[2] dan mengangkat sumpah pada 20 Mei 2008. Beliau dilantik semula mempengerusikan Kuomintang pada 17 Oktober 2009.[3] dan mempertahankan jawatan presidennya pada 2012 dengan 51.5% undi.[4]
.svg){kind=small}
