アルギニンtRNAリガーゼ

アルギニンtRNAリガーゼ
識別子
EC番号	6.1.1.19
CAS登録番号	37205-35-9
データベース
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB構造	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー	AmiGO / QuickGO
検索 PMC articles PubMed articles NCBI proteins

アルギニルtRNAシンテターゼN末端ドメイン
酵母のアルギニルtRNAシンテターゼ
識別子
略号	Arg_tRNA_synt_N
Pfam	PF03485
InterPro	IPR005148
SCOP	1f7u
SUPERFAMILY	1f7u
利用可能な蛋白質構造: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

アルギニンtRNAリガーゼ(Arginine—tRNA ligase、EC 6.1.1.19)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。

ATP + L-アルギニン + RNA${\displaystyle \rightleftharpoons }$AMP + 二リン酸 + L-アルギニルtRNAArg

従って、この酵素は、ATPとL-アルギニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アルギニルtRNAArgの3つの生成物を持つ。

この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アルギニン:tRNAArgリガーゼ(AMP生成)(L-Arginine:tRNAHis ligase (AMP-forming))である。アルギニルtRNAシンターゼ、アルギニントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アルギニン、プロリンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。N末端に、アルギニル tRNAシンテターゼN末端ドメインまたはアディショナルドメイン1(Add-1)と呼ばれる保存ドメインを持つ。このドメインは約140残基の長さで、tRNA認識に関わっていると考えられている^[1]。

構造

2007年末時点で、4個の構造が解かれている。蛋白質構造データバンクのコードは、1BS2、1F7U、1F7V、1IQ0である。

出典

1. Cavarelli J, Delagoutte B, Eriani G, Gangloff J, Moras D (September 1998). “L-arginine recognition by yeast arginyl-tRNA synthetase”. EMBO J. 17 (18): 5438–48. doi:10.1093/emboj/17.18.5438. PMC 1170869. PMID 9736621. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1170869/. 

関連文献

• ALLENDE CC, ALLENDE JE (1964). “PURIFICATION AND SUBSTRATE SPECIFICITY OF ARGINYL-RIBONUCLEIC ACID SYNTHETASE FROM RAT LIVER”. J. Biol. Chem. 239: 1102–6. PMID 14165914. 
• Mehler AH, Mitra SK (1967). “The activation of arginyl transfer ribonucleic acid synthetase by transfer ribonucleic acid”. J. Biol. Chem. 242 (23): 5495–9. PMID 12325365. 
• Mitra SK and Mehler AH (1967). “The arginyl transfer ribonucleic acid synthetase of Escherichia coli”. J. Biol. Chem. 242: 5491–5494.