ELK1

ELK1
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1DUX

識別子
記号ELK1, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK1
外部IDOMIM: 311040 MGI: 101833 HomoloGene: 3832 GeneCards: ELK1
遺伝子の位置 (ヒト)
X染色体
染色体X染色体[1]
X染色体
ELK1遺伝子の位置
ELK1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点47,635,521 bp[1]
終点47,650,604 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
X染色体 (マウス)
染色体X染色体 (マウス)[2]
X染色体 (マウス)
ELK1遺伝子の位置
ELK1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点20,799,634 bp[2]
終点20,816,847 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
クロマチン結合
血漿タンパク結合
二本鎖DNA結合
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞の構成要素 細胞質
axon terminus
核質
soma
樹状突起
ミトコンドリア
細胞核
生物学的プロセス 細胞分化
regulation of transcription, DNA-templated
response to light stimulus
cellular response to testosterone stimulus
response to fibroblast growth factor
positive regulation of neuron death
transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to gamma radiation
cellular response to lipid
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
regulation of transcription by RNA polymerase II
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_005229
NM_001114123
NM_001257168

NM_007922

RefSeq
(タンパク質)

NP_001107595
NP_001244097
NP_005220

NP_031948

場所
(UCSC)
Chr X: 47.64 – 47.65 MbChr X: 20.8 – 20.82 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

ELK1(ETS like 1)は、ヒトではELK1遺伝子によってコードされているタンパク質である[5]。ELK1は転写アクチベーターとして機能する。ETSファミリー英語版の下位分類であるTCF(ternary complex factor)サブファミリーに分類され、このファミリーは標的DNA配列への結合を調節する共通したドメインの存在によって特徴づけられる。ELK1は、長期記憶英語版の形成、薬物依存アルツハイマー病ダウン症候群乳がん抑うつなど、さまざまな状況下で重要な役割を果たしている。

構造

ELK1のドメイン構造

ELK1はいくつかのドメインから構成される。N末端領域に位置するAドメインは、DNAへの結合に必要である。この領域には核局在化シグナル(NLS)や核外搬出シグナル(NES)も含まれており、それぞれ核への移行と核からの搬出を担っている。Bドメインは、二量体化のコファクターである血清応答因子(SRF)との結合を可能にする。Bドメインに近接して位置するRドメインは、ELK1の転写活性の抑制に関与している。このドメイン内のリジン残基はSUMO化を受けている可能性が高く、この翻訳後修飾によってRドメインの阻害機能は強化される。Dドメインは、活性型MAPKへの結合に重要な役割を果たしている。C末端領域に位置するCドメインには、MAPKによってリン酸化されるアミノ酸残基が含まれている。この領域内では、セリン383番と389番がELK1を介した転写を起こすためにリン酸化が必要な重要部位となっている。最後に、DEFドメインはMAPKの一種であるERKとの特異的相互作用を行う領域である[6]

発現

ELK1は転写因子として機能するため、神経細胞以外では核内に発現している。成熟した神経細胞では、このタンパク質は核と共に細胞質にも存在している[6]。分裂期を終えた神経細胞では、sELK1と呼ばれるバリアントが核内にのみ発現している。このバリアントは全長タンパク質に存在するNESを欠いている[7]。ELK1は幅広く発現しているが、その発現レベルは組織によって異なる。一例としてラットの脳にElk1は非常に豊富に存在するが、ほぼ神経細胞にのみ発現している[8]

スプライスバリアント

ELK1遺伝子からは全長タンパク質以外にも、∆ELK1、sELK1と呼ばれる短いタンパク質も産生される。∆ELK1は選択的スプライシングによって生み出され、SRFとの相互作用を可能にするDNA結合ドメインの一部を欠いている[9]。一方、sELK1はSRFとの結合を担う領域は完全であるが、NESを含む最初の54アミノ酸を欠いている。sELK1は神経細胞にのみ存在し、ORF内部の翻訳開始部位を利用することで形成される[10]。∆ELK1とsELK1はどちらも全長タンパク質が切り詰められたタンパク質であり、DNA結合やさまざまな細胞シグナルの誘導が可能である。神経分化においてsELK1はELK1に対抗し、NGF/ERKシグナルを調節する[8]

シグナル伝達

ELK1の活性化をもたらすシグナル伝達経路

ELK1の下流の標的は、FOS遺伝子の血清応答エレメント(serum response element; SRE)である[11][12]FOS遺伝子にコードされるFOSタンパク質の産生を引き起こすためには、MAPKによるELK1のC末端領域のリン酸化が必要である[13][14]。MAPKは細胞膜で開始されるシグナル伝達経路の最終のエフェクターであり[15]、MAPKによるリン酸化はELK1のコンフォメーション変化を引き起こす[16]。MAPKの上流で作用するRafキナーゼは、MEKまたはMAPK/ERKをリン酸化して活性化する[17][18][19][20]。Raf自身はRasによって活性化され、RasはGRB2とSosを介してチロシンキナーゼ活性を有する成長因子受容体と関連づけられている[21]。GRB2とSosは成長因子が対応する受容体に結合した後にのみ、Rasを刺激する。一方でRafの活性化はRasのみに依存しているのではなく、ホルボールエステルによって活性化されるプロテインキナーゼC英語版もRasと同様の機能を果たすことができる[22]。またMEKキナーゼもMEKを活性化し、その後MAPKを活性化するため、Rafが不必要になる場合もある[23]。このように、さまざまなシグナル伝達経路がMEKやMAPKに集約され、ELK1の活性化をもたらす。ELK1の刺激後には、ELK1をFOSプロモーターへの結合を可能にするSRFのリクルートが必要である。ELK1のSRFへの結合は、ELK1のBドメインとSRFとのタンパク質間相互作用、そしてAドメインを介したタンパク質-DNA間相互作用によって行われる[6]

上述したタンパク質群は、特定のシグナル出力のためのレシピのようなものである。これら構成要素の1つ、例えばSRFが欠けた場合には、異なる出力が生じる。このケースでは、SRFの欠損によってELK1による他の遺伝子の活性化が引き起こされる[16]。一例としてELK1はSRF非依存的にLCK英語版遺伝子に結合し、活性を示す[16]。また、SREとELK1結合部位との間隔や相対的配向は柔軟であるため[24]、SREによって調節されるFOS以外の最初期遺伝子もELK1の標的となっている可能性がある。EGR1英語版は、SREとの相互作用に依存したELK1の標的の一例である[16]

シグナル伝達の研究においては、下流の標的の活性化に利用される各構成要素の重要性が変異導入によって浮き彫りとなる場合がある。例えば、MAPKによってリン酸化されるC末端ドメインの破壊によって、FOSの活性化の阻害が引き起こされる[16]。同様に、通常はELK1をSREにつなぎとめる役割を果たしているSRFの機能不全によって、FOSの転写は生じなくなる[21]。またELK1が存在しない場合、SRFはMAPKによる刺激後もFOSの転写を誘導することができない[16]。このように、ELK1はシグナル伝達経路と遺伝子転写の開始を関連づける必要不可欠な役割を果たしている。

臨床的意義

長期記憶

長期記憶の形成はELK1に依存している可能性がある。MEK阻害薬英語版はELK1のリン酸化を遮断し、その結果として後天的な味覚嫌悪学習英語版が損なわれる。さらに、嫌悪刺激を防止する特定の応答の学習を伴う回避学習英語版は、海馬におけるERK、ELK1、FOSの活性化の明確な増加と相関している。海馬は短期・長期の情報記憶に関与する脳領域である。ラットの海馬においてELK1またはSRFのDNA結合を遮断した際には、SRFを隔離した場合にのみ長期空間記憶英語版への干渉がみられる。すなわちELK1のDNAとの相互作用は記憶形成に必要不可欠ではない可能性があるが、ELK1の活性化はDNAへの結合を必要としない他の分子イベントの引き金となっている場合があるため、その特異的役割に関してはさらなる研究が必要である。例えばELK1はヒストンのリン酸化、SRFとの相互作用の増大、基本転写因子のリクルートに関与しており、これらの過程は全てELK1のDNAへの直接的結合を必要としない[6]

薬物依存

ELK1の活性化は薬物依存に中心的役割を果たしている。マウスではコカインの投与後に、線条体で強力かつ一過的なERKとElk1の高リン酸化状態が観察される。その後MEK阻害薬が投与されると、Elk1のリン酸化はみられなくなる。活性化型Elk1が存在しない場合、c-Fosの産生やコカイン誘発性の条件付け場所嗜好性英語版が遮断されることが示されている。さらに、エタノールの急性摂取は扁桃体におけるElk1の過剰なリン酸化をもたらす。また、Elk1活性のサイレンシングはオピオイドの離脱シグナルや長期治療に対する細胞応答を低減することも示されている。これらの結果は、ELK1が薬物依存における重要な構成要素であることを浮き彫りにしている[6]

病態生理

アミロイドβ(Aβ)の蓄積は、アルツハイマー病の原因もしくは引き金となることが示されている。AβはBDNFによって誘導されるELK1のリン酸化に干渉する。この経路によるELK1の活性化が妨げられた場合、SREを介して駆動される遺伝子調節によって神経細胞の脆弱性の増大がもたらされる。ELK1はアミロイドβ前駆体タンパク質(APP)に対して行われる逐次的プロセシングの最終段階に必要なプレセニリン1(PS1)の転写も阻害する。この最終段階の切断によってアミロイド原性の高いAβ42/43が形成され、またPS1は家族性アルツハイマー病の最も早発性の症例と遺伝的に関連している。これらのデータは、Aβ、ELK1、そしてPS1との興味深い関連性を強調している[6]

ELK1はダウン症候群とも関連している。マウスモデルでは胎児と老齢マウスの双方において、Elk1に対する主要なホスファターゼであるカルシニューリンの活性低下が示されている。これらのマウスでは、加齢依存的なERK活性化の変化も観察される。さらに、ELK1の活性を抑制するSUMO3英語版の発現もダウン症成人患者では増加している。このように、ダウン症候群はERK、カルシニューリン、SUMO経路と関係しており、これらはすべてELK1活性に対して拮抗的に作用する[6]

ELK1はBRCA1のスプライスバリアント、すなわちBRAC1a、BRCA1bとも相互作用する。この相互作用はBRCA1を介した乳がん細胞の成長抑制作用を高める。ELK1は成長制御経路においてBRCA1の下流の標的である可能性がある。BRCA1aをトランスフェクションした乳がん細胞ではFOSのプロモーター活性が阻害され、またBRCA1a/1bの過剰発現はMEKを介したSREの活性化を低下させる。これらの結果は、BRCA1a/1bによる成長抑制や腫瘍抑制の機構の1つとして、FOSなどのELK1の下流の標的遺伝子の発現抑制を介した作用があることを示している[25]

抑うつはELK1と関連づけられている。自殺者の剖検試料では、海馬や前頭前野においてERKを介したELK1のリン酸化の低下が観察されている。ERKシグナルのバランスの異常は抑うつや自殺行動と相関している。今後の研究により、抑うつの病理におけるELK1の正確な役割が明らかにされることが期待される[6]

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000126767 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009406 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “elk, tissue-specific ets-related genes on chromosomes X and 14 near translocation breakpoints”. Science 244 (4900): 66–70. (1989). Bibcode1989Sci...244...66R. doi:10.1126/science.2539641. PMID 2539641. 
  6. ^ a b c d e f g h “Elk-1 a transcription factor with multiple facets in the brain”. Front Neurosci 5: 35. (2011). doi:10.3389/fnins.2011.00035. PMC 3060702. PMID 21441990. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3060702/. 
  7. ^ “In vivo expression and regulation of Elk-1, a target of the extracellular-regulated kinase signaling pathway, in the adult rat brain”. J. Neurosci. 18 (1): 214–26. (January 1998). doi:10.1523/JNEUROSCI.18-01-00214.1998. PMC 6793414. PMID 9412502. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6793414/. 
  8. ^ a b “Functional dissection of the transcription factor Elk-1”. Oncogene 9 (4): 1273–8. (April 1994). PMID 8134131. 
  9. ^ “Delta elk-1, a variant of elk-1, fails to interact with the serum response factor and binds to DNA with modulated specificity”. Cancer Res. 53 (2): 215–20. (January 1993). PMID 8417810. 
  10. ^ “Opposing roles of Elk-1 and its brain-specific isoform, short Elk-1, in nerve growth factor-induced PC12 differentiation”. J. Biol. Chem. 276 (7): 5189–96. (February 2001). doi:10.1074/jbc.M006678200. PMID 11050086. 
  11. ^ “Ets-related protein Elk-1 is homologous to the c-fos regulatory factor p62TCF”. Nature 354 (6354): 531–4. (1991). Bibcode1991Natur.354..531H. doi:10.1038/354531a0. PMID 1722028. 
  12. ^ “Characterization of SAP-1, a protein recruited by serum response factor to the c-fos serum response element”. Cell 68 (3): 597–612. (February 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90194-H. PMID 1339307. 
  13. ^ “Phosphorylation-dependent formation of a quaternary complex at the c-fos SRE”. Mol. Cell. Biol. 16 (3): 1094–102. (March 1996). doi:10.1128/mcb.16.3.1094. PMC 231092. PMID 8622654. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC231092/. 
  14. ^ “c-fos transcriptional activation and repression correlate temporally with the phosphorylation status of TCF”. EMBO J. 12 (6): 2377–87. (June 1993). doi:10.1002/j.1460-2075.1993.tb05892.x. PMC 413468. PMID 8389697. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC413468/. 
  15. ^ Marx J (February 1993). “Cell death studies yield cancer clues”. Science 259 (5096): 760–1. Bibcode1993Sci...259..760M. doi:10.1126/science.8430327. PMID 8430327. 
  16. ^ a b c d e f “Activation of ternary complex factor Elk-1 by MAP kinases”. EMBO J. 12 (13): 5097–104. (December 1993). doi:10.1002/j.1460-2075.1993.tb06204.x. PMC 413771. PMID 8262053. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC413771/. 
  17. ^ “Activation of mitogen-activated protein kinase kinase by v-Raf in NIH 3T3 cells and in vitro”. Science 257 (5075): 1404–7. (September 1992). Bibcode1992Sci...257.1404D. doi:10.1126/science.1326789. PMID 1326789. 
  18. ^ “Activation of the MAP kinase pathway by the protein kinase raf”. Cell 71 (2): 335–42. (October 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90361-F. PMID 1330321. 
  19. ^ “Raf-1 activates MAP kinase-kinase”. Nature 358 (6385): 417–21. (July 1992). Bibcode1992Natur.358..417K. doi:10.1038/358417a0. PMID 1322500. 
  20. ^ “Identification and characterization of a new mammalian mitogen-activated protein kinase kinase, MKK2”. Mol. Cell. Biol. 13 (8): 4539–48. (August 1993). doi:10.1128/mcb.13.8.4539. PMC 360070. PMID 8393135. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC360070/. 
  21. ^ a b “Complexes of Ras.GTP with Raf-1 and mitogen-activated protein kinase kinase”. Science 260 (5114): 1658–61. (June 1993). Bibcode1993Sci...260.1658M. doi:10.1126/science.8503013. PMID 8503013. 
  22. ^ “Protein kinase C alpha activates RAF-1 by direct phosphorylation”. Nature 364 (6434): 249–52. (July 1993). Bibcode1993Natur.364..249K. doi:10.1038/364249a0. PMID 8321321. 
  23. ^ “A divergence in the MAP kinase regulatory network defined by MEK kinase and Raf”. Science 260 (5106): 315–9. (April 1993). Bibcode1993Sci...260..315L. doi:10.1126/science.8385802. PMID 8385802. 
  24. ^ “Spatial flexibility in ternary complexes between SRF and its accessory proteins”. EMBO J. 11 (12): 4631–40. (December 1992). doi:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05565.x. PMC 557039. PMID 1425594. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC557039/. 
  25. ^ “c-Fos oncogene regulator Elk-1 interacts with BRCA1 splice variants BRCA1a/1b and enhances BRCA1a/1b-mediated growth suppression in breast cancer cells”. Oncogene 20 (11): 1357–67. (March 2001). doi:10.1038/sj.onc.1204256. PMID 11313879. 

外部リンク

  • Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: P19419 (ETS domain-containing protein Elk-1) at the PDBe-KB.

Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!