カリフォルニア州バークレー出身。1970年、Livermore High School を卒業すると、マークルは計算機科学を学ぶためにカリフォルニア大学バークレー校に進学し、1974年に学士号、1977年に修士号を取得した。1979年、スタンフォード大学で電気工学の博士号を取得した論文は Secrecy, authentication and public key systems(秘匿、認証と公開鍵システム) と題されていた。彼はジョージア工科大学のコンピューティング学科の教授となった[1]。ラルフ・マークルは、有名な野球選手フレッド・マークルの親戚(兄弟の孫)である。
Ralph C. Merkle, Secrecy, authentication, and public key systems (Computer science), UMI Research Press, 1982, ISBN 0-8357-1384-9.
Robert A. Freitas, Ralph C. Merkle, Kinematic Self-Replicating Machines, Landes Bioscience, 2004, ISBN 1-57059-690-5.
Paul Kantor (Ed), Gheorghe Mureşan (Ed), Fred Roberts (Ed), Daniel Zeng (Ed), Frei-Yue Wang (Ed), Hsinchun Chen (Ed), Ralph Merkle (Ed), "Intelligence and Security Informatics" : IEEE International Conference on Intelligence and Security Informatics, ISI 2005, Atlanta, GA, USA, May 19-20, ... (Lecture Notes in Computer Science), Springer, 2005, ISBN 3-540-25999-6.