アメリカ連合国財務長官(あめりかれんごうこくざいむちょうかん、Confederate States Secretary of the Treasury)は、アメリカ連合国財務省の長である。アメリカ連合国大統領が指名し、連合国議会の承認によって任命される。
アメリカ連合国が建国した1861年から消滅した1865年まで、財務長官にはクリストファー・メミンジャー、ジョージ・トレンホルム、ジョン・レーガンの3人が就任した。