La carriera di Seo Jae-duck inizia nei tornei scolastici, giocando con la Gwangju Electronic Technical High School, e poi partecipando a tornei universitari con la Sungkyunkwan University. Nella stagione 2011-12 firma il suo primo contratto professionistico, ingaggiato in V-League dai KEPCO 45, in seguito rinominato KEPCO Vixtorm; nel 2013 riceve inoltre le prime convocazioni nella nazionale sudcoreana, vincendo un anno dopo la medaglia d'oro alla Coppa asiatica 2014, venendo inoltre premiato come miglior giocatore e miglior opposto del torneo, e quella di bronzo ai XVII Giochi asiatici.