La Sala Clementina è ricoperta da affreschirinascimentali e varie opere d'arte di notevole importanza. La sala è usata dal papa come sala per le udienze a delegazioni di particolare importanza, come il corpo diplomatico accreditato presso la Santa Sede, il collegio dei cardinali, le varie conferenze episcopali. Nella Sala Clementina viene inoltre esposto, dopo la morte, il corpo del papa affinché i membri della curia e le delegazioni straniere possano rendergli omaggio prima della traslazione nella Basilica di San Pietro.
Affreschi
Sopra le porte principali che consentono l'accesso alla sala è collocato l'affresco intitolato il Martirio di san Clemente del pittore fiammingo Paul Bril. Nella parete opposta vi sono gli affreschi del Battesimo di san Clemente, dei pittori italiani Cherubino Alberti e Baldassare Croce, e un'Allegoria dell'Arte e della Scienza di Giovanni e Cherubino Alberti. I fregi sulle pareti laterali raffigurano le allegorie delle virtù cardinali di Alberti e Croce e, sulla parete opposta, delle virtù teologali da parte degli stessi artisti. Sul soffitto è dipinta l'Apoteosi di san Clemente di Giovanni Alberti.