Il 28 aprile 2011, Amukamara fu scelto come 19º dai New York Giants nel Draft 2011[2][3]. Il giorno successivo la firma del contratto coi Giants, Prince si ruppe il metatarso del piede sinistro[4].
Nella prima serie della sua carriera coi Giants, Amukamara mise a segno un intercetto su un passaggio di Vince Young contro i Philadelphia Eagles. La stagione regolare della sua stagione da rookie si concluse con 7 presenze, nessuna delle quali da titolari, con 14 tackle ed 1 intercetto. Nei playoff, i Giants giunsero fino al Super Bowl XLVI dove sconfissero i New England Patriots 21-17 e Amukamara vinse il primo Super Bowl della carriera[5].
Nella sua seconda stagione, Prince disputò 13 partite, 11 delle quali come titolare, mettendo a segno 53 tackle e un intercetto, coi Giants che non riuscirono però a qualificarsi per i playoff.
Il primo intercetto del 2014, Amukamara lo fece registrare nella vittoria della settimana 3 sugli Houston Texans[6] e il secondo quattro giorni dopo contro i Redskins[7]. La sua annata si chiuse con un nuovo primato personale di tre, pur avendo disputato solamente otto partite.
Nel terzo turno del 2015, Amukamara fece registrare il primo intercetto della stagione, che coincise con la prima vittoria dei Giants, nella gara del giovedì notte sui Redskins.
Jacksonville Jaguars
L'11 marzo 2016, Amukamara firmò un contratto di un anno con i Jacksonville Jaguars.
Chicago Bears
Il 10 marzo 2017, Amukamara firmò con i Chicago Bears.
^(EN) 2011 National Football League Draft, Pro Football Hall of Fame, 2 maggio 2011. URL consultato il 28 settembre 2012 (archiviato dall'url originale il 28 aprile 2012).
