Il torneo è stato creato nel 2012 grazie ai fondi ottenuti dalla federazione calcistica del Bhutan a seguito di un accordo triennale di sponsorizzazione del valore di 3 milioni di ngultrum siglato con la multinazionaleCoca-Cola[2][3]. In precedenza la massima divisione nazionale era la A-Division a cui prendevano parte solo le squadre della città di Thimphu[4].
Nel 2019 sono avvenuti cambiamenti strutturali nel sistema dei campionati e le competizioni sono state rinominate. Il livello più alto è stato ribattezzato Bhutan Premier League e la competizione di qualificazione Bhutan Super League. La Super League è cessata dopo la stagione 2020 ed è stata sostituita dal torneo di qualificazione per la Premier League.
La competizione si svolge con la formula del girone all'italiana con gare di andata e ritorno. Il sistema di punteggio prevede 3 punti per la vittoria, 1 per il pareggio e 0 per la sconfitta.
Alle squadre meglio classificate al termine del campionato è destinato un premio in denaro: nelle prime edizioni questo era di 400.000 ngultrum per la prima mentre la seconda e la terza classificata ricevevano rispettivamente 200.000 e 100.000 ngultrum[5]. Dal 2015 il premio per i campioni è salito ad 1 milione di ngultrum[1].
Fino al 2014 la squadra che si laureava campione otteneva anche il diritto a partecipare alla Coppa del Presidente dell'AFC dell'anno successivo, dal 2015 in poi la vincente si qualifica invece per il turno preliminare della AFC Cup.
^ab(EN) Younten Tshedup, Final games to decide league title, su kuenselonline.com, 22 settembre 2015. URL consultato il 28 ottobre 2016 (archiviato dall'url originale il 24 maggio 2016).
^(EN) Upasana Dahal, Bhutan National League picks up heat, Thebhutanese.bt, 28 dicembre 2012. URL consultato il 19 gennaio 2013 (archiviato dall'url originale il 6 gennaio 2013).
^(EN) Tashi Phuntsho, To open artificial turf, Kuenselonline.com, 13 dicembre 2012. URL consultato il 19 gennaio 2013 (archiviato dall'url originale il 2 aprile 2015).
^(EN) Nima Wangdi, Certified coaches a must for clubs, Kuenselonline.com, 10 dicembre 2012. URL consultato il 19 gennaio 2013 (archiviato dall'url originale il 2 gennaio 2014).
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