Dal momento che LyX era rivolto alla platea di Linux, iniziò poi ad esplorare differenti modi per migliorare le interfacce grafiche di tale sistema operativo, che alla fine portarono alla nascita del progetto KDE, da lui fondato nel 1996, quando propose su Usenet un "ambiente desktop libero, consistente e carino" (consistent, nice looking free desktop-environment) per sistemi Unix-like utilizzando Qt come toolkit.[1][2]
