Ha studiato regia all'Accademia per la televisione e il cinema di Monaco di Baviera.[1] Nel 1993 ha esordito con un mediometraggio, Donne senza trucco, che l'ha portata alla ribalta nazionale e internazionale.[1] In seguito ha diretto il film Bandits: pur dividendo la critica, la pellicola ha ottenuto in patria un grande successo commerciale.[1] Alla fine degli anni '90 Katja von Garnier si è trasferita negli Stati Uniti, dove ha diretto due pellicole.[1] Ha nuovamente realizzato un film in Germania nel 2013, con il primo capitolo della fortunata saga Windstorm, di cui ha poi diretto anche due seguiti.[1]
Vita privata
Ha due figli, nati dal suo matrimonio con il collega e connazionale Markus Goller.