Nel 1777, Ménageot presentò per l'accettazione all'Académie Royale L'addio di Polissena a Ecuba (Chartres, Musée des Beaux-Arts) ma fu eccettato solo nel 1780 con Lo studio ferma il tempo (Parigi, École Nationale Supérieure des Beaux-Arts). Al Salon del 1781 inviò il Leonardo da Vinci muore tra le braccia di Francesco I (oggi ad Amboise), che deriva dalla Morte di Germanico di Nicolas Poussin.
Nel 1787 fu nominato direttore dell'Accademia di Francia a Roma (preferito a David), posto che occupò fino al 1792, dal momento che fu soppresso nel novembre di quell'anno. Nel 1800 figurò tra i dieci migliori pittori francesi nella lista stilata da Jean-Baptiste-Pierre Le Brun su richiesta di Luciano Bonaparte e nel 1808 dipinse Il matrimonio del principe Eugène de Beauharnais con la principessa Amélie di Baviera (Versailles, Musée national du château et des Trianons). Decorato con la Legione d'onore, fu membro dell'Institut de France nel 1809.
François Guillaume Ménageot fece parte di quegli artisti che condussero la pittura francese al cosiddetto «Grand Genre», ossia alla pittura di storia, religiosa e mitologica che, secondo Félibien, dovrebbe avere il primato rispetto a ogni altro genere, rinnovandola con composizioni di grande formato orizzontale, ornamentazioni monumentali e colori freddi.