Questa prima edizione fu caratterizzata dall'assenza di alcuni top club europei, in quanto iscritti alla SuproLeague, un'altra competizione continentale per club organizzata dalla FIBA in seguito ai dissidi con l'ULEB.
Disputa tra ULEB e FIBA
La EuroLeague (meglio conosciuta fino a quel momento come FIBA European Champions' Cup), venne inizialmente fondata dalla FIBA ed è stata organizzata dalla stessa dal 1958 fino all'estate dell'anno 2000, quando si concluse la stagione 1999-2000. Fu in quel momento che venne creata la Euroleague Basketball Company.
Fino a quel momento la FIBA non aveva mai registrato il marchio "EuroLeague", quindi la Euroleague Basketball poté utilizzarlo semplicemente senza alcun problema legale; la FIBA si trovò così a dover scegliere un nuovo nome per la propria competizione. Fu così che all'inizio della stagione 2000-2001 si crearono due competizioni europee per club totalmente separate: la FIBA SuproLeague (precedentemente conosciuta come FIBA EuroLeague) e la nuova EuroLeague.
Le note tra parentesi indicano la modalità di qualificazione di ogni squadra.
1°, 2°, ecc.: Posizioni in campionato prima dei playoff
WC: Wild Card
Regular season
Nella prima fase della competizione, la regular season, le squadre partecipanti sono state divise in quattro gironi da sei team ciascuno. Ogni squadra gioca contro le altre cinque per due volte, una in casa ed una in trasferta. Le migliori quattro classificate di ogni girone, avanzano alla fase successiva, le Top 16.
In caso due o più squadre abbiano gli stessi punti al termine della regular season, vengono applicati i seguenti criteri:
Miglior record negli scontri diretti.
Migliore differenza canestri negli scontri diretti.
Migliore differenza canestri in tutta la regular season.
Maggior numero di punti segnati nell'intera regular season.
Migliore somma del quoziente dei punti segnati e dei punti subiti di ogni partita dell'intera regular season.
Le sedici squadre qualificate, si sono affrontate in una serie al meglio delle tre gare; le vincenti di ogni serie si sono qualificate per i quarti di finale.
Le partite sono state giocate dal 31 gennaio al 14 febbraio 2001.
Le migliori otto squadre, si sono affrontate in una serie al meglio delle tre gare; le vincenti di ogni serie si sono qualificate per le semifinali.
Le partite sono state giocate dal 21 febbraio al 7 marzo 2001.
Le quattro semifinaliste si sono affrontate in una serie al meglio delle cinque gare per avere un posto in finale.
Le partite sono state giocate dal 27 marzo al 7 aprile 2001.
A maggio 2001 c'erano due squadre campioni d'Europa, il Maccabi Tel Aviv vincitrice della Suproleague e la Kinder Bologna, vincitrice della Euroleague. Le due organizzazioni si resero quindi conto della necessità di negoziare tra loro, per avere una sola massima competizione europea. Essendo in una posizione di forza, l'Euroleague Basketball Company ha dettato le condizioni alle quali la FIBA ha dovuto sottostare, non avendo potere di contrattazione. Di conseguenza l'Eurolega venne presa in carico totalmente dalla Euroleague Basketball Company e le squadre iscritte alla Suproleague si iscrissero alla stagione successiva di Euroleague. Venne inoltre sancito che nella stagione 2000-2001, ci furono due squadre vincitrici del titolo europeo.
Un anno dopo, l'Euroleague Basketball Company e la FIBA decisero che la EuroLeague divenne la massima competizione europea per club del continente europeo. Venne inoltre deciso che la FIBA Europe avrebbe organizzato un campionato di terzo livello, la FIBA Europe, mentre l'Euroleague Basketball Company avrebbe organizzato un campionato di secondo livello, combinando la Coppa Korać e la Coppa Saporta in un'unica competizione, l'EuroCup. Nel 2005, le due organizzazioni decisero di collaborare, collaborazione che andò avanti fino al 2016.
In pratica, la FIBA continuò ad occuparsi delle competizioni per le nazionali di pallacanestro (come ad esempio FIBA EuroBasket, FIBA World Cup e le Olimpiadi estive), mentre la Euroleague Basketball prese in carico tutte le competizioni per club europei.