Elisabetta morì durante il suo soggiorno presso la corte di Varsavia, dove suo marito sarebbe stato insignito del titolo ducale dal re polacco Stefan Batory. Elisabetta fu sepolto nella Cattedrale di Königsberg. Suo marito ordinò allo scultore olandese Willem van Bloche la realizzazione di un monumento per la sua tomba che venne completata nel 1582.