Elisabetta Francesca si fidanzò, l'8 aprile 1912[4], con il conte Georg von Waldburg Zeil e Hohenems (1878-1955), che sposò il 19 settembre 1912 a Niederwallsee. Fu un matrimonio d'amore e non politico. Georg non possedeva soldi o proprietà ed era stato assunto come precettore per i suoi fratelli.
Elisabetta Francesca morì il 29 gennaio 1930,[6] tre anni dopo la nascita del suo ultimo figlio, all'età di trentotto anni, nel castello Syrgenstein. Suo marito, nel 1931, si risposò con la sorella minore di Elisabetta Francesca, Gertrude.