La contea di Pawnee (in inglesePawnee County) è una contea dello Stato del Kansas, negli Stati Uniti. La popolazione al censimento del 2010 era di 6 973 abitanti. Il capoluogo di contea è Larned.
La contea di Pawnee è divisa in ventuno township.
La città di Larned è considerata governmentally independent quindi esclusa dai dati del censimento per le Township.