Il confine riguarda la parte sud-occidentale della Lituania. Per quanto attiene alla Russia, il confine interessa l'exclave russa dell'oblast' di Kaliningrad. Ha un andamento generale da nord-ovest a sud-est.
Per più di cento km il confine corre lungo il fiume Nemunas, mentre altri 51 km sono segnati da parte del corso del fiume Šešupė. Uno dei ponti più celebri che collega i due Stati è il ponte della regina Luisa.
Regioni interessate
Sono tre le contee della Lituania interessate dal confine. Dal lato russo figura solo la regione di Kaliningrad: