Bagot servì come membro del Parlamento per Castle Rising (1807-1808). È stato cancelliere del King's College, (oggi l'University of Toronto) (1842-1843).
Come una concessione importante, Bagot permise ai leader politici coloniali canadese Robert Baldwin e Sir Louis-Hippolyte Lafontaine di formare un ministero, sulla base delle loro maggioranze parlamentari. Lafontaine, come leader franco-canadese, aveva subito maltrattamenti dagli inglesi sotto il precedente governatore generale, Lord Sydenham. Questo è stato l'inizio di quello che divenne noto come il governo rappresentativo in Canada. La leadership di Bagot è stata un importante passo avanti nella creazione di rapporti più amichevoli tra la colonizzazione inglese e francese.
Bagot lavorò in modo produttivo con Baldwin e Lafontaine per stabilire una struttura per la governance municipale nella provincia del Canada. Con l'arrivo della Confederazione nel 1867 nacquero l'Ontario e il Québec.
Mentre prestava servizio come governatore generale, Bagot ordinò la prima estradizione di uno schiavo fuggitivo negli Stati Uniti dal Canada occidentale. Il latitante in questione, Nelson Hacket (o Hackett), era stato un cameriere e maggiordomo di una ricca proprietaria di schiavi dell'Arkansas. Nel 1841, Hackett ha rubato un cappotto di castoro e una cavalla da corsa dal suo padrone, così come un orologio d'oro e una sella da altri due, ed è fuggito nel Canada occidentale. Il padrone di Hacket lo raggiunse a Chatham, in Ontario, e Hacket è stato imprigionato. Secondo Bagot, Hacket aveva commesso un crimine rubando oggetti non necessari per la sua fuga, e per questo motivo è stato estradato.
Morte
Dopo aver terminato la sua carica come governatore generale, nel gennaio 1843, Bagot morì quattro mesi più tardi alla residenza vicereale, Alwington House, troppo malato per tornare nel Regno Unito.
Oggi, egli è ricordato soprattutto per il suo contributo allo sviluppo del "confine indifeso" tra gli Stati Uniti e in Canada, e per la promozione delle relazioni politiche tra i due principali gruppi coloniali: inglesi e francesi.
Bagot Street, una via principale nel centro di Kingston, è chiamato in sua memoria.