Lo Scià safavide Ismāʿīl I, nato ad Ardabil, avviò da qui la sua conquista dell'Iran, proclamando come capitale del suo nuovo regno Tabriz nel 1501.
Ardabil rimase comunque una città importante, sia politicamente sia economicamente, fino all'età contemporanea. Durante le frequenti guerre ottomano-persiane, essendo vicina ai confini dei due Imperi in lotta, fu spesso saccheggiata dagli Ottomani tra il 1514 e il 1722, come pure nel 1915, nel corso della prima guerra mondiale, quando l'Impero ottomano invase il confinante Iran.