Setnakhte bukan putra, saudara atau keturunan langsung baik Tausret atau Merneptah Siptah—yang pertama sebelum kedua firaun—juga bukan pendahulu Siptah, Seti II, yang dianggap Setnakht dengan resmi penguasa sah yang terakhir. Terdapat kemungkinan bahwa perampas yang merebut takhta selama masa krisis dan kerusuhan politik, atau ia dapat menjadi anggota garis kecil keluarga kerajaan Ramses yang muncul sebagai firaun. Senakhte menikahi Tiy-Merenese, yang diduga adalah putri Merneptah.
Hubungan di antara penerus Setnakhte dan Dinasti kesembilan belas Mesir dinyatakan oleh fakta bahwa salah satu anak Ramses II juga memiliki nama ini dan nama yang serupa dimiliki oleh keturunan Setnakhte seperti Ramses, Amun-her-khepshef, Seth-her-khepshef dan Monthu-her-khepshef.[1]