Mikropeptida dapat ditranskripsi dari 5'UTR, gen kecil, mRNA polisistronik, lncRNA yang dianotasi secara salah.
Mikropeptida (juga disebut mikroprotein) adalah polipeptida dengan panjang kurang dari 100-150 asam amino yang disandi oleh rangka baca terbuka pendek (short open reading frame, sORF).[1][2][3] Dalam hal ini, mikropeptida berbeda dari banyak polipeptida kecil aktif lainnya, yang diproduksi melalui pembelahan pascatranslasional dari polipeptida yang lebih besar.[1][4] Dalam hal ukuran, mikropeptida jauh lebih pendek daripada protein "kanonik", yang memiliki panjang rata-rata 330 dan 449 asam amino dalam prokariota dan eukariota secara berturut-turut.[5] Mikropeptida kadang-kadang dinamai sesuai dengan lokasi genomiknya. Misalnya, produk translasi dari rangka baca terbuka hulu (upstream open reading frame, uORF) dapat disebut peptida yang disandi uORF (uORF-encoded peptide, uPEP).[6] Mikropeptida tidak memiliki urutan pensinyalan terminal-N, yang menunjukkan bahwa mikropeptida cenderung terlokalisasi di sitoplasma.[1] Namun, beberapa mikropeptida telah ditemukan di kompartemen sel lain, seperti yang ditunjukkan oleh keberadaan mikropeptida transmembran.[7][8] Mikropeptida dapat ditemukan dalam prokariota dan eukariota.[1][9][10] sORF yang menjadi asal mikropeptida yang ditranslasi dapat disandi dalam 5' UTR, gen kecil, atau mRNA polisistronik. Beberapa gen penyandi mikropeptida pada awalnya dianotasi secara salah sebagai RNA non-penyandi panjang (long non-coding RNA, lncRNA).[11]
Karena ukurannya yang kecil, sORF pada awalnya diabaikan. Namun, ratusan ribu mikropeptida diduga telah diidentifikasi melalui berbagai teknik pada banyak organisme. Hanya sebagian kecil dari ini dengan potensi penyandian yang memiliki ekspresi dan fungsi yang dikonfirmasi. Mikropeptida yang telah dikarakterisasi secara fungsional, secara umum, memiliki peran dalam pensinyalan sel, organogenesis, dan fisiologi seluler. Semakin banyak mikropeptida yang ditemukan, semakin banyak fungsinya. Salah satu fungsi regulasi adalah fungsi peptoswitch, yang menghambat ekspresi urutan penyandi hilir dengan menghentikan ribosom, melalui aktivasi langsung atau tidak langsung oleh molekul kecil.[11]
^ abcdCrappé J, Van Criekinge W, Menschaert G (2014). "Little things make big things happen: A summary of micropeptide encoding genes". EuPA Open Proteomics. 3: 128–137. doi:10.1016/j.euprot.2014.02.006.
^Hashimoto Y, Kondo T, Kageyama Y (June 2008). "Lilliputians get into the limelight: novel class of small peptide genes in morphogenesis". Development, Growth & Differentiation. 50 Suppl 1: S269–76. doi:10.1111/j.1440-169x.2008.00994.x. PMID18459982.
^Rothnagel J, Menschaert G (May 2018). "Short Open Reading Frames and Their Encoded Peptides". Proteomics. 18 (10): e1700035. doi:10.1002/pmic.201700035. PMID29691985.
