Ekbatana pertama kali diekskavasi pada tahun 1913 oleh Charles Fossey.[2] Penggalian arkeologi lainnya dilakukan pada tahun 1977.
Kontroversi
Orang Yunani menganggap Ekbatana adalah ibu kota kerajaan Media yang didirikan pertama kali oleh Deioces (Daiukku pada inskripsi bahasa paku (kuneiform)).
Tetapi pengkaitan dengan tempat penggalian ini diperdebatkan karena saat ini tidak ada bukti kehadiran orang Media di Hagmatana hill sebelum zaman Parthia sesudahnya.[3]
Ekbatana merupakan ibu kota Astyages (Istuvegü), yang direbut oleh raja Persia Koresh Agung pada tahun ke-6 Nabonidus (549 SM), menurut catatan Tawarikh Nabonidus.