A Mátrix-filmek harmadik részében az emberek és gépek közti elkeseredett háború katasztrófával fenyegető záróakkordjához érkezik: Zion katonái, bátor civil önkéntesekkel az oldalukon- mint Zee és a Kölyök – kétségbeesetten harcolnak, hogy visszaverjék az őrszemek támadását, amikor a géphadsereg fúrórobotjai betörnek a zioni dokkba.
A teljes megsemmisüléssel szembesülve az emberiség utolsó bástyájának lakói nem csak saját életükért, de magáért az emberiség jövőjéért küzdenek. Csakhogy egy ismeretlen elem megmérgezi a belső soraikat is: Smith, az immár öntudatra ébredt program megszállja Bane-t, a hajóflotta egyik tagját. Smith már kikerült a gépek ellenőrzése alól, uralma alá vonta a Mátrixot és minden egyes másodperccel erősebbé válik. Az a célja, hogy elpusztítsa a Gépeket Zionnal együtt. Az Orákulum végleges útmutatást ajánl Neonak, de ő fenntartásokkal fogadja a szavait, amiért az Építész csapdájára nem figyelmeztette előre.
Niobe hajójával Neo és Trinity messzebbre merészkednek, mint eddig bármelyik ember – egy végzetes és mindent eldöntő utazásra indulnak a Föld megperzselt felszínén a gépek városának szívébe. Ebben a hatalmas mechanikus metropoliszban Neo alkut ajánl a gépek legfőbb vezérének, Deus Ex Machinának.
Szereplők
A szócikk egy része még lefordítandó. Segíts te is a fordításban!