Első filmjét 1987-ben 5000 dollárból rendezte. Második filmje, a The Long Weekend, melyet maga írt, rendezett és fényképezett már komoly sikereket ért el a fesztivállátogató kritikusok körében. Az 1992-es The Living End-et már a Sundance Filmfesztivál nagydíjára jelölték.
Következő három filmjét a Tinédzser Apokalipszis Trilógia néven szokták emlegetni. A Totally Fucked Up hat meleg fiatal szétcsúszott életét mutatja be; az Elátkozott generáció c. fekete komédia egy erőszakkal és erotikával átszőtt road movie; az Út a pokolba egy amerikai középiskola elidegenedett diákjaink droggal, szexszel és űrlényekkel átszőtt életét viszi filmvászonra.
A korábbi filmjeitől eltérő hangvételű Csók, macsók!-at az 1999-es Sundance Filmfesztiválon mutatták be, a pozitív hangvételű film azonban nem aratott osztatlan sikert a rajongók körében.
Hosszabb hallgatás után 2004-ben tért vissza Titokzatos bőr c. filmjével, amelyben újra a korábbi témák jelennek meg, a történet középpontjában két tizenéves áll, az egyik prostituáltként dolgozik, a másik meg van róla győződve, hogy űrlények rabolták el; a film során az életüket összekötő múlt sötét titkaira derül fény.
Araki szexuális irányultságát nyíltan vállalja, de visszautasítja hogy „meleg filmrendezőnek” állítsák be. „Úgy látszik van ez a kategorizációs szükséglet, hogy mindent egy dobozba tegyünk bele. Én egyszerűen csak olyan filmeket csinálok, amelyek megfognak.”[1]