Za švicarski trećeligaški klub Meyrin debitirao je 20. listopada 2007. u ligaškoj utakmici protiv selekcije Siona do 21 godine. Meyrin je tu utakmicu izgubio 1:2 te je Moubandje na ovoj utakmici postigao svoj jedini gol za klub.[4]
Servette
U siječnju 2010. ponovno se pridružio drugoligaškom švicarskom klubu Servetteu.[5] Za Servette je debitirao 14. ožujka u ligaškoj utakmici protiv Vaduza kojeg je Servette dobio 1:2.[6] Nastupao je 31. svibnja 2011. kada je Servette pobijedio Bellinzonu 3:1 u uzvratnoj utakmici doigravanja. Tom je pobjedom Servette ostvario promociju u Švicarsku Superligu.[6] U Švicarskoj Superligi debitirao je 23. srpnja 2011. kada je Servette pobijedio Zürich 2:3.[6] Svoj prvi gol za klub postigao je 26. listopada kada je Grasshopper u ligaškoj utakmici poražen 1:4.[6]
Toulouse
Dana 1. rujna 2013. Moubandje je potpisao četverogodišnji ugovor s Toulouseom.[7] Servette je za taj transfer dobio milijun eura.[8] Za Toulouse je debitirao 14. rujna u prvoligaškoj utakmici protiv Marseillea (1:1).[9][10] Svoj prvi gol za klub postigao je 19. siječnja 2016. kada je Paris Saint-Germain porazio Toulouse 2:1 u utakmici francuskog kupa.[10]
Dana 3. rujna 2020. Dinamo je posudio Moubandjea turskom prvoligašu Alanyasporu.[8][13][14] Devet dana kasnije debitirao je u utakmici Süper Liga protiv Sivasspora kojeg je Alanyaspor dobio 0:3.[15] Svoj prvi gol za klub postigao je 4. listopada u ligaškoj utakmici protiv Hatayspora (6:0).[15] U kupu je debitirao 16. prosinca kada je Alanyaspor porazio Adanaspor 5:1.[15]
Göztepe (posudba)
Dana 8. siječnja 2022. poslan je na posudbu u turski prvoligaški klub Göztepe do kraja sezone.[16] Za novi klub debitirao je 22. siječnja kada je İstanbul Başakşehir poražen 1:2.[17] U kupu je debitirao 10. veljače kada je Beşiktaş u produžetcima izbacio Göztepe rezultatom 3:1.[17]
Sion
Dana 31. kolovoza 2022. Moubandje je potpisao za švicarski klub Sion.[18]
