פפה התחיל את הקריירה שלו במחלקת הנוער של רומא, אך לא זכה לשחק בקבוצה הבוגרת. לאחר שעבר בלקו ובטראמו, בקיץ 2003, חתם בפלרמו. פפה היה שותף ב-19 משחקים והבקיע שער אחד ועלה עם המועדון לראשונה בתולדותיו לסרייה א'. ביולי 2004 הושאל לפיאצ'נצה על מנת לצבור דקות משחק. ביוני 2005 פפה חזר לפלרמו.
ב-9 ביוני2010, הושאל ליובנטוס תמורת 2.6 מיליון אירו עם אופציה לרכוש את כרטיס השחקן שלו לאחר חודש תמורת 7.5 מיליון אירו. ב-1 ביולי2010 יובנטוס מימשה את האופציעה. בעונתו הראשונה במועדון הוא הבקיע 5 שערים ב-30 משחקים. בעונת 2011/2012 זכה פפה עם המועדון באליפות ראשונה לאחר 7 שנים. בסיום עונת 2014/2015 שוחרר מהקבוצה.
