בזמן פעילות המשלחת תחנת החלל כללה את המודול הבסיסי, מודול "קוואנט 1", מודול "קוואנט 2" ומודול "קריסטל". שטח מחיה היה 253 מ"ק והספק מיוצר על ידי פאנלים סולארים היה 25 קו"ט.
ב-9 ביולי חברי משלחת מס' 15 עזבו את תחנת החלל בחללית סויוז TM-18.ולרי פוליאקוב נותר בתחנת החלל והיצטרף למשלחת מס' 16. משלחת מס' 16 החלה את פעילותה הסדירה.
מחקרים שבוצעו על ידי צוות התרכזו בעיקר בתחום רפואה. ויקטור פוליאקוב היה רופא והשגיח על ביצוע מחקרים. חלק מהמחקרים בוצעו לפי תוכנית שעובדה בגרמניה ונתונים על התקדמותה היו מועברים למרכז הבקרה הגרמני. מדענים גרמנים היו עוברים על הממצאים ומשנים את מהלך הניסוי במידת הצורך. נושא נוסף היה בדיקת השפעת חוסר כבידה על עצמות הגוף. פוליאקוב בדק מצבם חברי הצוות וביצע מדידות שונות כולל פעילות הלב כל שלוש ימים.
ב-2 בספטמבר יורי מלנצ'נקו ביצע עגינה ידנית והיא הצליחה. עם החללית הגיע מטען של 2,355 ק"ג[1]. צוות החל בהעברת המטען לתחנת החלל.
ב-9 בספטמבר מלנצ'נקו ומוסאבייב ביצעו פעילות חוץ-רכבית שנמשכה כ-5 שעות. בתחילת הפעילות הם בדקו סביבת תא עגינה של חללית מטען והתברר שהיא תקינה. בהמשך הם עשו פעולות הכנה למעבר פאנל סולארי ממודול "קריסטל" למודול "קוואנט 1".
ב-14 בספטמבר מלנצ'נקו ומוסאבייב ביצעו פעילות חוץ-רכבית שנמשכה כ-6 שעות. בתחילת הפעילות הם ביצעו פעולות תחזוקה. בהמשך הם המשיכו בפעולות הכנה למעבר פאנל סולארי ממודול "קריסטל" למודול "קוואנט 1".
ב-11 באוקטובר התרחשה תקלה במערכת חשמל של תחנת החלל. לא היה ניתן לכוון פאנל סולארי כי אספקת חשמל למחשב נפסקה. בעזרת מדחפי חללית "סויוז TM-20" צוות הצליח להזיז את תחנת החלל וייצור החשמל חודש בהדרגה לקראת 15 באוקטובר. לאור בעיות אלו תוכנית ניסויים של מרבולד עודכנה.
ב-3 בנובמבר מלנצקנו, מוסאבייב ומרבולד נכנסו לחללית סויוז TM-19 והתרחקו מתחנת החלל ל-190 מ'. לאחר מכך בוצע עגינה לבחינת תקינות מערכת עגינה אוטומטית. עגינה עברה ללא בעיות.
במהלך שהות בחלל שנמשכה כ-4 חודשים משלחת ביצעה מספר רב של ניסויים בתחומים שונים.
ב-4 בנובמבר מלנצקנו, מוסאבייב ומרבולד נכנסו לחללית סויוז TM-19 פעם נוספת ועזבו תחנת החלל.