Doe't Nederlân troch Frankryk ynlive wie (1810) rôp keizer Napoleon Daendels werom. Hy waard kommandant fan in difyzje fan it napoleontyske leger en die mei oan de fjildtocht fan Napoleon nei Ruslân.
Hy waard 1815 fan kening Willem I fan de Nederlannen beneamd ta gûverneur-generaal fan it Nederlânsk besit oan de Goudkust. Maart 1816 besette er dy funksje. Alle projekten dy't er stâl besike te jaan mislearren lykwols.
Daendels stoar 1818 oan malaria en waard byset op it Nederlânsk begraafplak fan Elmina.