Yitzchak Yaacov Reines devient ensuite le rabbin et l'Av Beth Din de Švenčionys (Vilnius), en Lituanie. Il y fonde sa première yechiva, où il fait aussi enseigner les matières séculaires, ce qui crée une opposition et elle doit fermer ses portes peu après[4].
Rabbin de Lida
Il est le rabbin de Lida, dans l'Empire russe, aujourd'hui en Biélorussie, pendant 30 ans, de 1885 jusqu'à sa mort en 1915. Il fonde la Yechiva de Lida en 1905, où les matières séculaires sont également enseignées, une nouveauté pour l'époque[5].
Premier Congrès sioniste (Bale, 1897)
Yitzchak Yaacov Reines participe au Premier Congrès sioniste (Bâle, 1897)[5].
Création du Mizrachi
En 1902, il organise une conférence du mouvement sioniste religieux à Vilnius, où se fond le mouvement Mizrachi. En 1904 à Pressburg (Bratislava) a lieu le congrès de fondation du mouvement, dont il devient le leader[5].
Mort
Yitzchak Yaacov Reines est mort le (10 Eloul 5675), à l'âge de 75 ans[4].
Œuvres
(he) Edut be-Ya’ako (sur les témoignages), Vilnius, 1872