Né à Bréda aux Pays-Bas, Sydney van Hooijdonk est notamment formé par le NAC Breda, où il commence sa carrière professionnelle. Il joue son premier match le , lors d'une rencontre d'Eredivisie face au FC Utrecht. Il entre en jeu à la place de Karol Mets, et son équipe s'incline par deux buts à un[1]. Le club est toutefois relégué à l'issue de la saison 2018-2019, le NAC Breda descendant officiellement après une nouvelle défaite, face au SC Heerenveen le 12 mai 2019 (2-1 score final) et termine 18e et dernier du championnat[2],[3].
Van Hooijdonk découvre donc la deuxième division néerlandaise lors de la saison 2019-2020. Il joue son premier match lors de la première journée, le 9 août 2019 contre le FC Dordrecht. Il entre en jeu et son équipe s'impose par deux buts à zéro[4]. Le 2 octobre 2020, alors que son équipe affronte le Jong Ajax en championnat, van Hooijdonk se fait remarquer en réalisant un hat-trick, le premier de sa carrière. Ces trois buts permettent à son équipe de l'emporter ce jour-là (4-0 score final)[5],[6].
Bologne FC
Le , Sydney van Hooijdonk rejoint l'Italie afin de s'engager en faveur du Bologne FC pour un contrat courant jusqu'en juin 2025[7]. Il est le quatrième joueur néerlandais de l'histoire du club[8].
SC Heerenveen
Le , lors du mercato hivernal, Sydney van Hooijdonk est prêté au SC Heerenveen jusqu'à la fin de la saison[9].
Il joue son premier match pour Heerenveen le , lors d'une rencontre de championnat contre le NEC Nimègue. Il est titularisé lors de cette rencontre perdue par son équipe (0-1 score final)[10].
Le , le prêt de van Hooijdonk au SC Heerenveen est prolongé pour une saison[11].
Norwich City
Le , Sydney van Hooijdonk est prêté par Bologne à Norwich City jusqu'à la fin de la saison. Le club dispose d'une option d'achat sur le joueur[12],[13].
Vie privée
Sydney van Hooijdonk est le fils de l'ancien international néerlandais Pierre van Hooijdonk[14].