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Avant de devenir membre officiel de Kraftwerk, il a travaillé pour le studio d'enregistrement du groupe, Kling Klang. Il est en effet mentionné dans les crédits de l'album et du DVD live Minimum-Maximum.
En 2008, Stefan Pfaffe remplace Florian Schneider après le départ de ce dernier, et intègre le groupe sur scène à la même place, à droite. Présent de 2008 à 2012, il est à son tour remplacé par Falk Grieffenhagen en 2013.