En , Sergio Lobera est pressenti pour devenir l'adjoint de l'entraîneur du FC Barcelone Tito Vilanova pour la saison 2012-2013[1], mais c'est finalement Jordi Roura qui est choisi.
Il devient entraîneur de l'UD Las Palmas en Liga Adelante pour la saison 2012-2013 et la suivante. Le , il est congédié de son poste à deux journées de la fin du championnat alors que Las Palmas occupe la 3e place.
Fin 2014, il est nommé entraîneur de l’équipe marocaine du Moghreb de Tétouan[2]. Début , il est limogé par le club.
Palmarès
En tant qu'entraîneur
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