La commune se trouve dans la région historique du Salzkammergut, à environ 25 kilomètres à l'est de Salzbourg et à 20 kilomètres à l'ouest de Bad Ischl. Elle est limitrophe, au nord et à l'est, du Land de Haute-Autriche.
Située sur la rive ouest du lac Wolfgangsee, à 545 m d'altitude, la municipalité est nichée dans les montagnes du massif du Salzkammergut, vis-à-vis du Schafberg (1 782 m) qui se dresse au-dessus de la localité de Ried. Les communes voisines sur le lac sont Strobl et Sankt Wolfgang. Plus au nord-est, le territoire communal s'étend jusqu'aux rives du lac de Mondsee et de l'Attersee.
Histoire
Le nom de la municipalité vient du saint patron de la paroisse, Gilles l'Ermite (en allemand : Ägidius), déformé en Gilgen.
Il n'est pas indifférent de rappeler les attaches familiales de Mozart avec ce coin de terre béni : sa mère, Anna Maria Pertl, y naquit en 1720 et sa sœur Maria Anna (« Nannerl ») s'y établit après son mariage avec le baron Berchtold zu Sonnenburg, en poste au village. Une plaque sur la maison du tribunal rappelle ce souvenir, tandis qu'une « fontaine de Mozart » était élevée en 1927 sur la place centrale, devant la mairie.
Vers la fin du XIXe siècle, Sankt Gilgen est devenu un lieu de villégiature de nombreuses personnalités du monde économique et politique, comme le chirurgien Theodor Billroth, et également des artistes.
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