Surnommé Chamuco[1], Samuel Eugenio joue durant pratiquement toute sa carrière (de 1980 à 1989) au sein de l'Universitario de Deportes (281 matchs joués pour 12 buts marqués)[1]. Il remporte avec ce club trois championnats du Pérou en 1982, 1985 et 1987[1]. Au niveau international, il joue avec l'Universitario quatre éditions de la Copa Libertadores en 1983, 1985, 1988 et 1989 pour un total de 11 matchs joués (deux buts inscrits)[2].
Défenseur rude sur l'homme, il fait parler de lui lorsqu'il blesse gravement l'attaquant argentin Enrique Boné du Sporting Cristal au tibia-péroné lors d'un match de championnat le [3]. Il s'agit de l'une des blessures les plus graves produites dans le football péruvien[3].
Il termine sa carrière en jouant pour le Sport Boys en 1991.
International péruvien entre 1984 et 1985, il ne dispute que des matchs amicaux avec la sélection péruvienne, dont trois rencontres contre l'Uruguay et une contre la Bolivie[4].