Le , The Last Ship est renouvelée pour une troisième saison de treize épisodes dont la diffusion est prévue en été 2016[1]. Tandis que les deux premières saisons mettaient en vedette le début de la maladie et comment celle-ci a presque anéanti toute la civilisation, la troisième se concentrera sur la reconstruction de l'Amérique[2].
Le , Bridget Regan intègre la distribution dans le rôle récurrent de Sasha Cooper, un ancien officier de la Naval Intelligence sous couverture diplomatique en Chine pour le nouveau gouvernement des États-Unis[3]. Neuf jours plus tard, Elisabeth Röhm est annoncée dans un rôle également récurrent, celui du chef de cabinet du président Michener[4]. Le tournage a débuté en [5]. En , le début de la diffusion de la saison est annoncé pour le [6]. Cependant, en raison de la fusillade du 12 juin 2016 à Orlando et d'une scène similaire présente dans le premier épisode, TNT reporte le début de la diffusion de la saison à une date indéterminée[7]. Deux jours après, la chaîne annonce que le début de la diffusion débutera le [8].
États-Unis : 1,78 million de téléspectateurs[10] (première diffusion)
Résumé détaillé
Plusieurs mois après que les États-Unis ont commencé à se reconstruire et la mort du docteur Scott, Chandler est le nouveau chef des Opérations navales et Slattery le nouveau capitaine du Nathan James. Alors que Chandler est en Chine pour essayer de savoir pourquoi le président chinois ne fait aucun effort afin de transmettre le remède au reste de la population en Asie, Slattery et plusieurs autres officiers sont pris en embuscade dans une boîte de nuitvietnamienne alors qu'ils établissaient des relations publiques avec les habitants.
États-Unis : 1,78 million de téléspectateurs[10] (première diffusion)
Résumé détaillé
L'équipage de l'USS Nathan James enlevés sont faits prisonniers sur un bateau. Les lieutenants Green et Burk, seuls rescapés, tentent de rejoindre le port, mais le navire n'est plus à quai ; il a reçu l'ordre direct de s'éloigner.
Pendant ce temps, à Hong Kong, Chandler, Wolf et Sasha, aidés par Jessie, une amie de Sasha, se lancent à la recherche d'un hélico pour aller au Vietnam et retrouver les membres de l'équipage kidnappés.
États-Unis : 2,41 millions de téléspectateurs[11] (première diffusion)
Résumé détaillé
Chandler, Wolf, Sasha, Green et Burk ont réussi à rejoindre l'USS Nathan James avec l'aide de Jessie. Ils découvrent que les hommes d'équipage kidnappés l'ont été par des pirates qui fréquentent régulièrement la ville de Shenzhen et s'y rendent. Chandler est bien décidé à retrouver ses hommes et comprendre ce qui se trame derrière tout ça.
De leur côté, les prisonniers sont déplacés dans un camp et rencontrent le leader des pirates, Takehaya...
États-Unis : 1,97 million de téléspectateurs[12] (première diffusion)
Résumé détaillé
Takehaya, le chef des pirates, envoie au président Michener un message, dans lequel il lui ordonne de retirer les destroyers américains des îles d'Okinawa au Japon, faute de quoi il exécuterait les prisonniers un par un.
Lors du message vidéo, Slattery et Jeter révèlent en secret leurs coordonnées géographiques à Chandler ; mais l'USS Nathan James a besoin d'être ravitaillé. Chandler et quelques-uns de son équipe s'infiltrent dans la demeure du président Peng, et lui ordonnent de retirer ses navires du port afin de permettre le ravitaillement du "Nathan James", mais aussi de leur révéler son implication dans l'explosion de l'avion militaire américain.
États-Unis : 2,50 millions de téléspectateurs[13] (première diffusion)
Résumé détaillé
Grâce à une carte trouvée dans le bureau du président Peng, l'USS Nathan James se dirige vers une zone restreinte d'îles où pourraient être retenus ses membres d'équipage. Proche d'une d'elles, le navire se retrouve au milieu d'une zone très fortement minée. Commence alors une course contre la montre pour déminer le lieu sans faire exploser le navire.
À Saint-Louis, le président Michener est confronté au comité de direction des régions qui réclame des comptes concernant la situation en Asie...
États-Unis : 2,34 millions de téléspectateurs[14] (première diffusion)
Résumé détaillé
Les pirates se mettent à fuir leur camp lorsqu'ils apprennent que la Navy approche. Les prisonniers l'ont également compris et envoient un dernier signal à l'USS Nathan James afin qu'il puisse les localiser précisément.
Arrivés sur place, Chandler et son équipe éliminent les hommes de Takehaya avant d'être attaqués par les services secrets chinois. Le "Nathan James" les élimine avec un tir à distance, et les prisonniers sont sauvés et ramenés à bord ; Takehaya est arrêté.
La mission de sauvetage est réussie, mais au prix de la perte de quatre hommes.
États-Unis : 2,46 millions de téléspectateurs[15] (première diffusion)
Résumé détaillé
De retour sur l'USS Nathan James, les membres d'équipage kidnappés se remettent doucement. Le Commandant Slattery reprend son poste, épaulé par Chandler. Takehaya, fait prisonnier, est interrogé. Il accuse les États-Unis d'avoir voulu empoisonner son pays. Chandler veut comprendre pourquoi le remède n'a pas fonctionné au Japon.
Au même moment, quatre navires de la flotte du président Peng se rapprochent. L'USS Nathan James passe en mode furtif...
À Saint-Louis, le journaliste Jacob Barnes rencontre l'assassin du Docteur Scott, enfermé en prison, et découvre la vérité à propos du passé non lointain du président Michener, notamment sur le fait qu'il a manqué de responsabilité en transférant son fils, contaminé, dans le lieu où il se trouvait, lui et sa famille, ainsi que des milliers d'autres gens. Barnes finit par dévoiler cette vérité au public.
États-Unis : 2,40 millions de téléspectateurs[16] (première diffusion)
Résumé détaillé
Les États-Unis sont en deuil à la suite du décès du président Michener. Le vice-président, Howard Oliver, est en route pour Saint-Louis afin de prendre ses nouvelles fonctions.
De son côté, l'USS Nathan James fait route vers Shenzhen pour retrouver Wu Ming, un trafiquant qui pourrait fournir à la Navy des informations sur les projets du président Peng, mais en arrivant sur place, la ville était totalement détruite. La Navy réussit à localiser Wu Ming avec l'aide de Takehaya. Chandler et son équipe le trouvent en train d'être torturé par les services secrets chinois. Après avoir éliminé ces derniers, ils découvrent des numéros de référence d'un bateau transportant une cargaison de Peng.
L'USS Nathan James parvient à intercepter ce bateau, et y découvre un missile chinois transportant un gaz. Après l'avoir analysé, le Docteur Rios conclut que ce gaz pouvait empêcher le remède de s'attaquer au virus. C'est ce même gaz qui a été propagé au Japon et au Vietnam par le président Peng.
États-Unis : 2,002 millions de téléspectateurs[17] (première diffusion)
Résumé détaillé
Chandler présume que le président Peng procède à un génocide. Il a fait fabriquer des missiles contenant un virus qui neutralise le remède et les a envoyés stratégiquement sur l'Asie. L'USS Nathan James fait cap sur une petite île où ils auraient été confectionnés afin d'en savoir plus. Chandler et son équipe découvrent la prochaine cible de Peng, La Corée.
De retour sur le « Nathan James », Takehaya leur suggère une route que le navire transportant les missiles de Peng pourrait prendre. Deux destroyers américains prêtent main-forte au « Nathan James » afin de détruire le navire chinois. Mais ils sont immédiatement pris en embuscade.
À Saint-Louis, Kara comprend enfin ce qui bloque depuis des semaines les messages vidéos : des messages vocaux cryptés, donnant à chaque fois les coordonnées de l'équipage du « Nathan James ». Kara découvre aussi que tout ceci s'agit d'un complot impliquant Allison Shaw, le chef de cabinet du président, le secrétaire Rivera ainsi que tous les sénateurs des régions...
États-Unis : 2,32 millions de téléspectateurs[18] (première diffusion)
Résumé détaillé
Après la perte de deux navires et d'hommes de la Navy, Chandler est plus décidé que jamais à mener à bien sa mission en Asie et anéantir le président Peng. Au même moment, à Saint-Louis, le nouveau président est forcé de démanteler, 48h seulement après sa prise de fonctions, toutes les mesures actées par son prédécesseur et émet un mandat d'arrêt à l'encontre de Chandler. Le Commandant Meylan prend le contrôle de l'USS Nathan James et veut rentrer en Amérique. Chandler suspecte un coup d'état au pays ; il peut compter sur le soutien de ses hommes afin de reprendre le commandement.
De son côté, Kara soupçonne le chef du cabinet présidentiel, Allison Shaw, d'être la taupe au sein de la Maison-Blanche. Elle demande de l'aide au journaliste Jacob Barnes.
États-Unis : 2,54 millions de téléspectateurs[19] (première diffusion)
Résumé détaillé
Aux États-Unis, Kara et Jacob Barnes, désormais en cavale, tentent d'obtenir de l'aide. Rejoints par Tex, ils retournent à Saint-Louis empêcher le président Oliver de faire son discours.
Au même moment, à l'est de la mer de Chine, Chandler tente de capturer le président Peng, venu à Tokyo détruire les archives nationales du Japon. L'équipage de l'USS Nathan James prend d'assaut l'un des deux derniers destroyers chinois, et met hors d'état de nuire l'autre. Chandler et son équipe éliminent tous les hommes de Peng, et Takehaya finit par le tuer.
À Saint-Louis, Kara, Jacob et Tex exfiltrent le président Oliver de la Maison-Blanche, mais Jacob est capturé et finit par être tué.
L'USS Nathan James, ainsi que tous les Américains, apprennent par les médias que le pays n'est plus dirigé de manière centrale, mais chaque région à part.
États-Unis : 2,13 millions de téléspectateurs[20] (première diffusion)
Résumé détaillé
Les États-Unis sont désormais sous l'autorité des dirigeants des régions. Kara et Tex, devenus des criminels recherchés, fuient en compagnie du président Oliver. Ils se rendent à San Diego où ils espèrent être rejoints par Chandler et l'équipage de l'USS Nathan James. Ce dernier y est, en effet, attendu afin de remettre son prisonnier : le Commandant Chandler, accusé de traîtrise par Allison Shaw.
Au même moment, dans le port de San Diego, un navire est détruit par un missile. Tout le monde croit le Nathan James coulé par le fond, c'était en réalité le destroyer chinois utilisé comme leurre. Chandler et son équipe débarquent discrètement et rejoignent Kara, Tex et le président. Leur plan est d'intercepter le train de marchandises qui transporte la nourriture stockée par Castillo, le dirigeant de la région sud-ouest. Rapidement ils apprennent que les wagons ne sont pas remplis de nourriture mais de gens affamés.
États-Unis : 2,27 millions de téléspectateurs[21] (première diffusion)
Résumé détaillé
Après avoir arrêté Castillo, Chandler décide de reprendre le contrôle des autres régions et envoie une équipe dans chacune d'elles afin d'intercepter leurs dirigeants. Il veut également arrêter Allison Shaw, à la tête du coup d'État. Mais cette dernière réussit à se dérober et tente d'exterminer l'USS Nathan James et son équipage avant de prendre la fuite. Les hommes de Chandler réussissent à l'intercepter dans un aérodrome avant que son avion ne décolle. Mais Shaw passe un coup de fil à Chandler: elle détient ses enfants à bord ; son père a été quant à lui tué. Chandler doit se rendre. Au moment où l'avion s'apprête à décoller avec Shaw et Chandler à bord, Tex s'introduit par l'arrière, et neutralise les hommes de Shaw, mais finit par être tué d'une balle reçue dans le ventre. Shaw continue de justifier ses actes jusqu'à ce que Chandler l'exécute.
Plus tard, sur le "Nathan James", Chandler remballe ses affaires, fait ses adieux à l'équipage et quitte la Navy.
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