Un phare avait été projeté à Point Reyes en 1855, mais la construction a été retardée de quinze ans en raison d'un différend entre le United States Lighthouse Board et les propriétaires fonciers au sujet d'un juste prix pour le terrain.
Le phare est une tour conique à seize pans, de 11 m de haut, un jumeau du phare du cap Mendocino. La première lentille de Fresnel de 1er ordre fut allumée le . L'électricité arriva au phare en 1938 et des escaliers en béton furent construits dans la falaise en 1939.
La station fut automatisée en 1975. Il émet, à une hauteur focale de 81 m, un éclat blanc toutes les 5 secondes. Sa portée est de 21 milles nautiques (environ 39 km).